山地の林内に自生する多年草。名前の由来は、アキ（秋）に、チョウジ（丁子）形の花を咲かせることから。（チョウジとはインドネシア原産の樹木で蕾を乾燥させて江戸時代に万能薬として市販された。胴長の意味がある）茎の断面は四角形、斜上し、高さは50-150cm。葉は対生し、葉柄は0.5-2cm、葉身は長さ5-15cmの狭卵形、先が尖り、縁に低い鋸歯があり、基部は楔形、側脈は3-4対。8-10月に枝先や葉腋に集散花序をだし、約2cmの青紫色の筒状の唇形花をつける。花冠は先が5裂、上唇は3裂、下唇は2裂。雄しべは4個。果実は径2mmの球形の分果。仲間のセキヤノアキチョウジによく似るが、アキチョウジの花柄は短いことから見分けることができる。